Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTGATGCTGATCAGAGGATAACTCATGACTTGGAGAAGTTAACAACAGACTTGTCAGGACTGGTCACTGGAATGGTAAAGCCATCTGTGGATATTTTGTGgtgagtaattcatttgcaaaatagagttattatgttactatggtgtattttacttgtacatggtcaattaacatattgatgcaaaatagttattatgctctttgtttttatttacttatcaagtactttcgttattctaaag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA05G31270.1
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA05G31270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 15
lower sequence: AT4G39850.2 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 16
TTGATGCTGATCAGAGGATAACTCATGACTTGGAGAAGTTAACAACAGACTTGTCAGGACTGGTCACTGGAATGGTAAAGCCATCTGTGGATATTTTGTGgtgagtaattcatttgcaaaatagagttattatgttactatggtgtattttacttgtacatggtcaattaacatattgatgcaaaatagttattatgctctttgtttttatttacttatcaagtactttcgttattctaaag
||||||| || |||||  | |||| |||| |||| ||||||||  | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| || || ||| | ||||  |||    ||  |    || || || | || ||  | |  ||  | ||  ||        | ||||| |||| ||    |||| |   | |                                                
TTGATGCGGACCAGAGACTCACTCGTGACCTGGAAAAGTTAACCGCTGACTTGTCTGGACTTCTTACTGGAATGGTAAAGCCATCGGTTGACATTCTCTGgtacgtacgctat--gttggattgatttctaatatttgtttcatggttcttggtt--------tgaattatcataatgcaaaaaaaaaacaaattgaag-------------------------------------------