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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctctattttactcctgaaacttccttgttttcacattcttttgaaactgaagttaatttgactgttccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G01930.2
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|51343889|gb|CO984622.1|CO984622
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCA--AA                         AA--TCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|13252662|gb|BG363565.1|BG363565
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCA--AA                         AA--TCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|51336381|gb|CO980247.1|CO980247
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCA--AA                         AA--TCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|31561807|gb|CD487645.1|CD487645
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCC----A                         AAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|7640202|gb|AW734508.1|AW734508
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCC----A                         AAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|192307576|gb|FG999615.1|FG999615
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCA--AA                         AA--TCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|31458946|gb|CD400974.1|CD400974
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCC----A                         AAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|10237782|gb|BE806670.1|BE806670
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCC----A                         AAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|26047345|gb|CA784166.1|CA784166
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCA--AA                         AA--TCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
EST: gi|51344356|gb|CO985089.1|CO985089
EST:     TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCC----A                         AAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG
genomic: TCACTTATGCTTGTCACATCCTTAAACCCAGTAAgtttcctcta ... actgttccagAAAATCGGTTATGACAAGGCAGCAACAGTTGCCAAGACAGCTCACAAAGAG