1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
TTGTAAGTGAGTATGCCGTGACTGGAAAAGATGCTGGGACAGGAAGCCTCTTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatacttattatgaagttttcattaagtattttatctagggccaggtttgaaattttgcacttttgcccaaaccacatatgcaagagattttttata...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G30450.1 |
intron # | 14 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGAEST: gi|33390367|gb|CA853562.1|CA853562
genomic: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
EST: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGAEST: gi|15285857|gb|BI469748.1|BI469748
genomic: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
EST: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGAEST: gi|13312086|gb|BG405737.1|BG405737
genomic: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
EST: CTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGAEST: gi|22523685|gb|BU082496.1|BU082496
genomic: CTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
EST: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGGTTCCTTATTGGACTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGAEST: gi|21888837|gb|BQ742050.1|BQ742050
genomic: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
EST: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGAEST: gi|4291961|gb|AI437694.1|AI437694
genomic: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
EST: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCEST: gi|13181153|gb|BG352493.1|BG352493
genomic: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGC
EST: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAG TGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
genomic: TTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatactt ... tctggtgcagTGATGTTATCCAAATGGCCAGCTATGCTCCACTTTTTGTTAATGCCAATGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTGTAAGTGAGTATGCCGTGACTGGAAAAGATGCTGGGACAGGAAGCCTCTTGGCAGCCCTAGCTGAAGCTGGCTTCCTAATTGGACTGGAAAAGAACAGgtttatacttattatgaagttttcattaagtattttatctagggccaggtttgaaattttgcacttttgcccaaaccacatatgcaagagattttttata
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAC