Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTCACCTTAACTGCCTTAGAGGAGATGTTTCAAGGTGCACGAGGTATCATGAGCTGGCTTGGTGACTGTGCAAAAgtatgttgcattactcattgtactgacatgcgtgtgtgtttggatagaaaattggttaagccgacagtgatgacatcagtataaggtgtcacttatatgattatgactaagacaatttgaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G51160.1
intron # 14
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA18G51160.1 (Glycine max), 5'ss of exon 14
lower sequence: Vv14s0083g00790.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 14
GTCACCTTAACTGCCTTAGAGGAGATGTTTCAAGGTGCACGAGGTATCATGAGCTGGCTTGGTGACTGTGCAAAAgtatgttgcattactcattgtactgacatgcgtgtgtgtttggatagaaaattggttaagccgacagtgatg-acatc-agtataaggtgtcacttatatgattatgactaagacaatttgaacag
 | || ||||||||  | | ||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |     || ||   | ||   ||| | |   | |  || |||  |||  | || | ||    ||||  | ||| |||   | | |  |  || | |  |                
ATTACTTTAACTGCTCTGGGGGAAATGTTTCAAGCTGCTCGCAGTATCATGAGCTGGCTTGGTGACTGTGCAAAGgtatgtgccact-----ttata---aaatatctgtttttaatgttgtaatatt--ttagacagaaactgccatacatggaatatcaggatgctcatgcaaaatgaggttt----------------