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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGGAGTGCGTGATCAATTATATAATTTGCAAATGCTTGAGGCAGCCCACTTCAAAATTCCACTACCCAAAGACTCGGAACGTCCCAGGACTTACACTCCTgtatgaattgctagttataatcaccctcatgctcattgaataatctattaaataatctattacatgctcattgatgaaccccccccccccccccccccccttttctttggttacgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G04690.2
intron # 14
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|58015793|gb|CX702535.1|CX702535
EST:     TCAAAATTCCACTACCCAAAGACTCGGAACGTCTCAGGACTTACACTCCT                         AAGCACCCAGCAATTACAGCTCCCAGCTATCCTCAAGTACAGGCACCTATT
genomic: TCAAAATTCCACTACCCAAAGACTCGGAACGTCCCAGGACTTACACTCCTgtatgaattg ... ggttacgcagAAGCACCCAGCAATTACACCTCCCAGCTATCCTCAAGTACAGGCACCTATT
EST: gi|57574010|gb|CX546985.1|CX546985
EST:     TCAAAATTCCACTACCCAAAGACTCGGAACGTCCCAGGACTTACACTCTT                         AAGCACCCAGCAATTACAGCTCCCAGCTATCCTCAAGTACAGGCACCTATT
genomic: TCAAAATTCCACTACCCAAAGACTCGGAACGTCCCAGGACTTACACTCCTgtatgaattg ... ggttacgcagAAGCACCCAGCAATTACACCTCCCAGCTATCCTCAAGTACAGGCACCTATT
EST: gi|7925968|gb|AW831994.1|AW831994
EST:     TCAAAATTCCACTACCCAAAGACTCGGAACGTCCCAGGACTTACACTCCT                         AAGCACCCAGCAATTACACCTCCCAGCTATCCTCAAGTACAGGCACCTATT
genomic: TCAAAATTCCACTACCCAAAGACTCGGAACGTCCCAGGACTTACACTCCTgtatgaattg ... ggttacgcagAAGCACCCAGCAATTACACCTCCCAGCTATCCTCAAGTACAGGCACCTATT