Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGCTTAAGGCAATGAGAGAATCTGTTTCAACAAAACCTGCTATCTTTGCCATGTCTAACCCCACCATGAATGgtttgtttgtacaaggctcatcaagcactcataattccttaatgatgtttatgttttttcattgactttttgttttttttttttatgtgtatggggacag...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA03G01680.1
intron # 14
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA03G01680.1 (Glycine max), 5'ss of exon 14
lower sequence: Vv15s0046g03670.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 13
GTGCTTAAGGCAATGAGAGAATCTGTTTCAACAAAACCTGCTATCTTTGCCATGTCTAACCCCACCATGAATGgtttgtttgtacaaggctcatcaagcactcataattccttaatg-atgtttatgttttttcattgactttttgtttttt---ttttttatgtgtatggggacag
||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | | |||  |  |||||||||| | | ||  || | | |    ||||   |  ||||||| |||| || |||   | || |||| || | |      
GTGCTTAAGGCCATGCGAGAATCCGATTCTACCAAACCTGCAATTTTTGCAATGTCAAATCCCACCATGAATGgtttgtgt-tgcaaaccctatcaagcacttacatttatttcaggcagacatatggcctc-cattgacatttttttctttgcatattctatg-gtgtag------