Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTATTTACATGGAAACAAGCTGACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgctttagtcattagttggccatatgcatcctgtatttcttttctggactcttgaaatcagcagtagcggcttgctgacaatagttaatcattt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G05900.3
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208314541|gb|GE113877.1|GE113877
EST:     ACTGGCCTCATCCCCCCAGTACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTT                         GGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
genomic: ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgct ... tcaattacagGGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
EST: gi|207823198|gb|GD794923.1|GD794923
EST:     ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTT                         GGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
genomic: ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgct ... tcaattacagGGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
EST: gi|208062441|gb|GD860519.1|GD860519
EST:     ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTT                         GGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
genomic: ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgct ... tcaattacagGGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
EST: gi|207746621|gb|GD721608.1|GD721608
EST:     ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTT                         GGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
genomic: ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgct ... tcaattacagGGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
EST: gi|193451692|gb|FK419848.1|FK419848
EST:     ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTT                         GGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
genomic: ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgct ... tcaattacagGGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
EST: gi|193652004|gb|FK597274.1|FK597274
EST:     ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTT                         GGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
genomic: ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgct ... tcaattacagGGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
EST: gi|208278224|gb|GE075721.1|GE075721
EST:     ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTT                         GGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA
genomic: ACTGGCCTCATCCCCCCAGAACTTGGAAATATGACAAACCTTCACTATTTgtaagatgct ... tcaattacagGGAATTGAATGACAACCATTTAAGTGGACATATCCCACCTGAGCTTGGAAA