1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
GTGCTTAGTGAGACATTTGATGTGATGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgatacatcatcatgttagtgttggatgcatttgcatgatcagcagtttggtacttagtgttctcaattgtcagggactatgatgtctaatgat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G04600.1 |
intron # | 13 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAG GTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGACEST: gi|207784650|gb|GD757757.1|GD757757
genomic: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgat ... tctgttgcagGTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGAC
EST: AATA-GCCTAATGTCAAGGAAAATCCCAG GTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGACEST: gi|208233521|gb|GE031976.1|GE031976
genomic: AATATGCCT-ATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgat ... tctgttgcagGTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGAC
EST: TTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAG GTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGEST: gi|193553500|gb|FK510473.1|FK510473
genomic: TTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgat ... tctgttgcagGTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTG
EST: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAG GTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTG-CEST: gi|207841950|gb|GD817194.1|GD817194
genomic: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgat ... tctgttgcagGTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGAC
EST: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAG GTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGACEST: gi|193674226|gb|FK619432.1|FK619432
genomic: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgat ... tctgttgcagGTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGAC
EST: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAG GTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGAC
genomic: TGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgat ... tctgttgcagGTTAAGTTCACCAAGACCGGGGTATGTCATGGATTTGTGCTGTGGATTGAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTGCTTAGTGAGACATTTGATGTGATGGAGTTTGATTTTTCAAAACAAATATGCCTATGTCAAGGAAAATCCCAGgtattatgatacatcatcatgttagtgttggatgcatttgcatgatcagcagtttggtacttagtgttctcaattgtcagggactatgatgtctaatgat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA