Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTAGACGAATGATTGGACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATGgtaagccttctacaccaaccccatcatcccttcccttttgttgcattaatgtgaaatatataaaacccatacaagagaagcttttctatacaagtagtag...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA03G32620.2
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193481417|gb|FK445962.1|FK445962
EST:     TGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATG                         CTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
genomic: TGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATGgtaagccttc ... ccccatgcagCTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
EST: gi|13240435|gb|BG359744.1|BG359744
EST:     ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATG                         CTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
genomic: ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATGgtaagccttc ... ccccatgcagCTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
EST: gi|254330519|gb|GR841784.1|GR841784
EST:     ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATG                         CTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
genomic: ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATGgtaagccttc ... ccccatgcagCTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
EST: gi|193665311|gb|FK613889.1|FK613889
EST:     TGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATG                         CTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
genomic: TGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATGgtaagccttc ... ccccatgcagCTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
EST: gi|8401969|gb|BE057603.1|BE057603
EST:     ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATG                         CTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
genomic: ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATGgtaagccttc ... ccccatgcagCTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
EST: gi|13480824|gb|BG510167.1|BG510167
EST:     ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATG                         CTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG
genomic: ACATGTAATTCAAACATCTGCTTCACATTACTTACTGTACAACTCATATGgtaagccttc ... ccccatgcagCTGTCTCTGCTGATGATCTGCACAAACATAAATGCTGAGCCCATGCAACCG