Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTATTGCTTTTACTAAACATTTGATTCACTTGTATGCTTGCACTGGATCAAATGAGCTAACCCAGCGTATAGAGgtgacattcttttcataaaaaatagctgaagttttgattgcagtttggtttacatctccttgtttaagcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G29090.1
intron # 12
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193544649|gb|FK501658.1|FK501658
EST:     TTCACTTGTATGCTTGCACTGGATCAAATGAGCTAACCCAGCGTATAGAG                         GTTGATGCTCATGTTGGGGGTGTGAATGACTTGGC
genomic: TTCACTTGTATGCTTGCACTGGATCAAATGAGCTAACCCAGCGTATAGAGgtgacattct ... gtttaagcagGTTGATGCTCATGTTGGGGGTGTGAATGACTTGGC
EST: gi|9986266|gb|BE660374.1|BE660374
EST:     TTCACTTGTATGCTTGCACTGGATCAAATGAGCTAACCCAGCGTATAGAG                         GTTGATGCTCATGTTGGGGGTGTGAATGACTTGGCATTTGCTCATCCAAAT
genomic: TTCACTTGTATGCTTGCACTGGATCAAATGAGCTAACCCAGCGTATAGAGgtgacattct ... gtttaagcagGTTGATGCTCATGTTGGGGGTGTGAATGACTTGGCATTTGCTCATCCAAAT
EST: gi|9986267|gb|BE660375.1|BE660375
EST:     TTCACTTGTATGCTTGCACTGGATCAAATGAGCTAACCCAGCGTATAGAG                         GTTGATGCTCATGTTGGGGGTGTGAATGACTTGGCATTTGCTCATCCAAAT
genomic: TTCACTTGTATGCTTGCACTGGATCAAATGAGCTAACCCAGCGTATAGAGgtgacattct ... gtttaagcagGTTGATGCTCATGTTGGGGGTGTGAATGACTTGGCATTTGCTCATCCAAAT