1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
ATTTGAACCATCTTTTCTTGGATATGCTGATGAGGTTGTTGAGGAGCGAATTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgattatacttgttcttgtagattatgtttttctttctcgatgaaagaataaattcataacgaccgaaaaacacaaggatctttggatatctatc...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G12970.1 |
intron # | 12 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|298165014|gb|HO011063.1|HO011063
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGTCCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|13562760|gb|BG550980.1|BG550980
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGTGCA GNCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGATEST: gi|14011018|gb|BG725940.1|BG725940
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|58022777|gb|CX709518.1|CX709518
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|14125209|gb|BG789656.1|BG789656
genomic: TGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|193444629|gb|FK407491.1|FK407491
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|58017859|gb|CX704601.1|CX704601
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|15200044|gb|BI424143.1|BI424143
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|18040540|gb|BM308834.1|BM308834
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAACCTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|51335203|gb|CO979069.1|CO979069
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: GATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAACCTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGACEST: gi|254323555|gb|GR836001.1|GR836001
genomic: GATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACA-GCGCA GTCACTTTGATTCTAEST: gi|58019703|gb|CX706445.1|CX706445
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTA
EST: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCA GTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
genomic: TTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgatt ... ttttctgtagGTCACTTTGATTCTAAGAGGTGCAAATGACCATATGCTTGATGAGATGGAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATTTGAACCATCTTTTCTTGGATATGCTGATGAGGTTGTTGAGGAGCGAATTTCTGATGATGCTGTAGTTATGATCAAAGGGACCAAAACTACAAGCGCAgtaagtgattatacttgttcttgtagattatgtttttctttctcgatgaaagaataaattcataacgaccgaaaaacacaaggatctttggatatctatc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gaaaaaca