1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
GTATGATTGGTTGGCAAAGAAGAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAGgtatgaaatgtttgttctgggatagttttcatgaaaaaatgtgaaaatctttggacctgttaactgttatgctagattcctcaaatattatatgctcggc...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G01100.1 |
intron # | 12 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAG GTCTCCTCATCACATATGTGGCTTTGAACTTGATGGATGGGCATGGTCAGCEST: gi|151409520|gb|EV279328.1|EV279328
genomic: GAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAGgtatgaaatg ... ttatctgcagGTCTCCTCATCACATATGTGGCTTTGAACTTGATGGATGGGCATGGTCAGC
EST: GAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAG GTCTCCTCATCACATATGTGGCTTTGAACTTGATGGATGGGCATGGTCAGCEST: gi|254319501|gb|GR829013.1|GR829013
genomic: GAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAGgtatgaaatg ... ttatctgcagGTCTCCTCATCACATATGTGGCTTTGAACTTGATGGATGGGCATGGTCAGC
EST: GAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAG GTCTCCTCATCACATATGTGGCTTTGAACTTGATGGATGGGCATGGTCAGC
genomic: GAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAGgtatgaaatg ... ttatctgcagGTCTCCTCATCACATATGTGGCTTTGAACTTGATGGATGGGCATGGTCAGC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTATGATTGGTTGGCAAAGAAGAACCTTCGGGCTGGATACTTCTTGTGGGCAATGACTGCCTACGGTTTAGgtatgaaatgtttgttctgggatagttttcatgaaaaaatgtgaaaatctttggacctgttaactgttatgctagattcctcaaatattatatgctcggc
- - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgaaaaaa