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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TAACTTTAGTAGACTGCATGATAGAAGCAAAGAAACCTCAAAAGTTATGAAGCAACTTAATCGCCTTTTTCCAAACAAAGTGACCATACAGTTGCCTCAGgtatcgtgttatattaatttgattttgcaatttataatgttgctaacttgctatttacaattcatatatctgtttcggttccaaacttgtacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G17400.1
intron # 12
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA02G17400.1 (Glycine max), 5'ss of exon 12
lower sequence: Vv07s0005g00200.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 15
TAACTTTAGTAGACTGCATGATAGAAGCAAAGAAACCTCAAAAGTTATGAAGCAACTTAATCGCCTTTTTCCAAACAAAGTGACCATACAGTTGCCTCAGgtatcgtgt-tatattaatttgattttgcaatttataatgttgctaacttgctatttacaattcatatatctgtttcggttccaaacttgtacag
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TAACTTTGGTAGACTGCATGATAGAAGCAAAGAAACCCCCAAGACAATGAAGCAACTCACTCGGCTTTTTCCAAACAAAGTGATGATACAGCTGCCACAGgtattgagcctacattcagtttatgacgaggt----ggtgcttct--ctggttacctgaaggaagta-ataaaatgtttgtgagaattgttgcag