Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACCCATGTAATTGCAGCAACTGATGCACATGGAGCATGCTCCAGGACGTTGAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATTgtaagttgtttaaggtttttgtttaatgctgcttacttgagttggtgcttattttttattttaattctggacaaatattggtgagtcacttaatagctcc...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G35010.3
intron # 11
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151401652|gb|EV271465.1|EV271465
EST:     GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATT                         GGATAAAAGCATGCATGCAAGAGATAAATCCTGTAGAGGAAGAACCGTATG
genomic: GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATTgtaagttgtt ... tgtactgtagGGATAAAAGCATGCATGCAAGAGATAAATCCTGTAGAGGAAGAACCGTATG
EST: gi|13478346|gb|BG507860.1|BG507860
EST:     GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATT                         GGATAAAAGCATGCATGCA
genomic: GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATTgtaagttgtt ... tgtactgtagGGATAAAAGCATGCATGCA
EST: gi|4287407|gb|AI441185.1|AI441185
EST:     GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATT                         GGATAAAAGCATGCATGCAAGAG
genomic: GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATTgtaagttgtt ... tgtactgtagGGATAAAAGCATGCATGCAAGAG
EST: gi|33388999|gb|CA852206.1|CA852206
EST:     GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATT                         GGATAAAAGCATGCATGCAAGAGATAAATCCTGTAGAGGAAGAACCGTATG
genomic: GAAAGTTCTGATGGCAATTCTAAATGGACGATGGGTTCTAAAAATGGATTgtaagttgtt ... tgtactgtagGGATAAAAGCATGCATGCAAGAGATAAATCCTGTAGAGGAAGAACCGTATG