1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
AGGAAATTTTGTACAACCAACAATTGTTGAGATTTCTCCCGATGCTCCTGTAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatatattctatatcttctttcattggactatttattttggagtttaatttatgattgaacttcatgattttctacttag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G19670.3 |
intron # | 11 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAG ACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGEST: gi|20448705|gb|BQ252829.1|BQ252829
genomic: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatata ... ttctacttagACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAA-CAATTCTGTACCTCAAGGATTAAG
EST: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAG ACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGTEST: gi|193615341|gb|FK564765.1|FK564765
genomic: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatata ... ttctacttagACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGT
EST: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAG ACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGTEST: gi|193472436|gb|FK438643.1|FK438643
genomic: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatata ... ttctacttagACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGT
EST: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAG ACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAEST: gi|192309267|gb|FG999144.1|FG999144
genomic: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatata ... ttctacttagACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTA
EST: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAG ACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTAC-TCAAGGAT-AAGTEST: gi|208314647|gb|GE112191.1|GE112191
genomic: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatata ... ttctacttagACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGT
EST: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAG ACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGGACAATTCTGTACCTEST: gi|15813675|gb|BI785950.1|BI785950
genomic: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatata ... ttctacttagACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCT
EST: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAG ACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGT
genomic: TAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatata ... ttctacttagACTCTGGAAGAAGCAATTGCCTTGAACAATTCTGTACCTCAAGGATTAAGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGGAAATTTTGTACAACCAACAATTGTTGAGATTTCTCCCGATGCTCCTGTAGTTAAAGAAGAATTGTTTGGTCCAGTTCTGTATGTTATGAAATTTCAGgtagcatatattctatatcttctttcattggactatttattttggagtttaatttatgattgaacttcatgattttctacttag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG