Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGTTCTCTTGTTCAAGAATACCTCAGGTTTTTAAATACAGCTAACAAgtaagtaaacatgtggttgtcatagagaatatattattgcctttaaatgagtcagcattttatgcctactatgagaaactcatcggtttatcttttgttattttatgttctaaatatgaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G25160.1
intron # 11
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|58020188|gb|CX706930.1|CX706930
EST:     AGTTCTCTTGTTCAAGAATACCTCAGGTTTTTAAATACAGCTAACAA                         GGAGGAATTNNNNNNNTTGAAG
genomic: AGTTCTCTTGTTCAAGAATACCTCAGGTTTTTAAATACAGCTAACAAgtaagtaaac ... atatgaacagGGAGGAATTAAAAAAATTGAAG
EST: gi|58023814|gb|CX710555.1|CX710555
EST:     AGTTCTCTTGTTCAAGAATACCTCAGGTTTTTAAATACAGCTAACAA                         GGAGGAATTNNNNNNNTTGAAG
genomic: AGTTCTCTTGTTCAAGAATACCTCAGGTTTTTAAATACAGCTAACAAgtaagtaaac ... atatgaacagGGAGGAATTAAAAAAATTGAAG
EST: gi|21594281|gb|BQ610112.1|BQ610112
EST:     AGTTCTCTTGTTCAAGAATACCTCAGGTTTTTAAATACAGCTAACAA                         GGAGGAATTNNNNNNNTTGAAG
genomic: AGTTCTCTTGTTCAAGAATACCTCAGGTTTTTAAATACAGCTAACAAgtaagtaaac ... atatgaacagGGAGGAATTAAAAAAATTGAAG