Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TATAGCATCTCTTGCCTTGTATACGAGGAAAATGCTCTTGGCCATGAGGCATGGCAATGGATCTAGTGTCTGCATCCTCTATGGACACCATAATTCAATGgttagtttgtgcacaatttcttgtccttcccattgaatttagtacctgaggtgttttttcctcatgctacataatactattttatattccttatttgttg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G00460.2
intron # 11
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151402728|gb|EV272541.1|EV272541
EST:     ATGGCAATGGATCTAGTGTCTGCATCCTCTATGGACACCATAATTCAATG                         AAACTGTGTCATGAAATGGGTCCAATAATTTCATTCAACTTGAAACGGCCT
genomic: ATGGCAATGGATCTAGTGTCTGCATCCTCTATGGACACCATAATTCAATGgttagtttgt ... tttaatccagAAACTGTGTCATGAAATGGGTCCAATAATTTCATTCAACTTGAAACGGCCT
EST: gi|7147103|gb|AW509025.1|AW509025
EST:     ATGGCAATGGATCTAGTGTCTGCATCCTCTATGGACACCATAATTCAATG                         AAACTGTGTCATGAAATGGGTCCAATAATTTCATTCAACTTGAAACGGCCT
genomic: ATGGCAATGGATCTAGTGTCTGCATCCTCTATGGACACCATAATTCAATGgttagtttgt ... tttaatccagAAACTGTGTCATGAAATGGGTCCAATAATTTCATTCAACTTGAAACGGCCT