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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTGAGGGACAGATCTCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatccgtatacttaaaatatacctagtttgcttgacctggtttctgtcatcagtctaattgagttgatttttgggttgtccaatctgaaataata...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G17810.5
intron # 11
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA08G17810.2 (Glycine max), 5'ss of exon 10
lower sequence: AT1G16470.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 11
GTTTGAGGGACAGATCTCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatccgtatacttaaaatatacctagtttgcttgacctggtttctgtcatcagtctaattgagttgatttttgggttgtccaatctgaaataata---
 ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||   ||||||| |   |     |    | ||   | ||  ||||||     || | | ||     | |  |||   ||||||  |    |||     |  | | ||||    
CTTTGAGGGAGAGATCTCAAGCAAAAATATTGAAATTGGCAAAATCGGTGCTGACAAAGTTTTCAGgtaccctttttctttgaaacaaagaatcttttttgctgctgatgatgtttg-----aatagaatgttgttgatactcaa-ttggttttttgggattaatgcag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|7285560|gb|AW598047.1|AW598047
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|193556539|gb|FK515192.1|FK515192
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGTGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGATGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|6719574|gb|AW307221.1|AW307221
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31473230|gb|CD415258.1|CD415258
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|151393662|gb|EV263537.1|EV263537
EST:     TCACGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACATCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31459786|gb|CD401814.1|CD401814
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|13789102|gb|BG651693.1|BG651693
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31465779|gb|CD407807.1|CD407807
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAG
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAG
EST: gi|31307072|gb|CD392275.1|CD392275
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|214008378|gb|DB986320.1|DB986320
EST:     CCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAAATGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|120494740|gb|EH222907.1|EH222907
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|120534400|gb|EH262533.1|EH262533
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31468638|gb|CD410666.1|CD410666
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31460635|gb|CD402663.1|CD402663
EST:     CAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGNGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: CAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTG-GAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31307394|gb|CD392597.1|CD392597
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|209701354|gb|BW655950.1|BW655950
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|120534404|gb|EH262537.1|EH262537
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|193501036|gb|FK464581.1|FK464581
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGTGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGA
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGA
EST: gi|19937016|gb|BQ081110.1|BQ081110
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|120533401|gb|EH261534.1|EH261534
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|57574332|gb|CX547307.1|CX547307
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|10253765|gb|BE821531.1|BE821531
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|151411669|gb|EV281480.1|EV281480
EST:     TCACGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGC
EST: gi|193603084|gb|FK558087.1|FK558087
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGTGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGATGACTATTTGGCTGAA
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAA
EST: gi|12772095|gb|BG237022.1|BG237022
EST:     TCAGGAAAAAACATTGGAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTTAG                         GGGATTGACCCCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTA
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTA
EST: gi|31468302|gb|CD410330.1|CD410330
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|15815210|gb|BI787485.1|BI787485
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAA
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAA
EST: gi|23062603|gb|BU578520.1|BU578520
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|120496074|gb|EH224241.1|EH224241
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|193392002|gb|FK353359.1|FK353359
EST:     GCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: GCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|209701353|gb|BW655949.1|BW655949
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|192331034|gb|FK020254.1|FK020254
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31463429|gb|CD405457.1|CD405457
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31309819|gb|CD395022.1|CD395022
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|21257195|gb|BQ454083.1|BQ454083
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|51343115|gb|CO983848.1|CO983848
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31309647|gb|CD394850.1|CD394850
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|5688439|gb|AI941454.1|AI941454
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTTAAGTAGGAATA-T
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAG-AATAAT
EST: gi|26058444|gb|CA801358.1|CA801358
EST:     TCAGGAAAGAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAA
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAA
EST: gi|21257387|gb|BQ454275.1|BQ454275
EST:     AAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: AAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|6726830|gb|AW311249.1|AW311249
EST:     TAAAAAGTTCAT                         GGT-TCGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|58014939|gb|CX701681.1|CX701681
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|15200642|gb|BI424453.1|BI424453
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31475106|gb|CD417134.1|CD417134
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|26058340|gb|CA801254.1|CA801254
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAA
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAA
EST: gi|31462312|gb|CD404340.1|CD404340
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|31310507|gb|CD395710.1|CD395710
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
genomic: TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatcc ... gatgttgcagGGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
EST: gi|193539952|gb|FK496962.1|FK496962
EST:     TCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAG                         GGTATTGACACCAGCTGAAATTGACGACTATTTGGCTGAAGTAGAATAATC
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EST: gi|21676482|gb|BQ628833.1|BQ628833
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EST: gi|14991049|gb|BI316722.1|BI316722
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EST: gi|9205182|gb|BE331406.1|BE331406
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EST: gi|58015356|gb|CX702098.1|CX702098
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTTTGAGGGACAGATCTCAGGAAAAAACATTGAAATTGGCATAATTGGAGCTGATAAAAAGTTCAGgtgcatatccgtatacttaaaatatacctagtttgcttgacctggtttctgtcatcagtctaattgagttgatttttgggttgtccaatctgaaataata

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGAT