1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
GGGCAACCAAACCGTGTCGAGAGTTTGAGAATAGCAATGAGGAAAGCTGGAGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgttaatgtcatataaaatatatacaagacagaaattcattgtgtttgctgtgttataaagaggacatatagtggtggatggattagttattcct...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G16670.1 |
intron # | 11 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTG CTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTGEST: gi|19347021|gb|BM891901.1|BM891901
genomic: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgtta ... ttgttaacagCTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
EST: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTG CTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTGEST: gi|10233855|gb|BE802743.1|BE802743
genomic: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgtta ... ttgttaacagCTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
EST: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTG CTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGANAGCGGAATTGGTGTTATTGEST: gi|9898831|gb|BE607799.1|BE607799
genomic: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgtta ... ttgttaacagCTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
EST: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTG CTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTGEST: gi|6847690|gb|AW349980.1|AW349980
genomic: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgtta ... ttgttaacagCTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
EST: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTG CTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTGEST: gi|9898619|gb|BE607587.1|BE607587
genomic: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgtta ... ttgttaacagCTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
EST: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTG CTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTGEST: gi|298188317|gb|HO035010.1|HO035010
genomic: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgtta ... ttgttaacagCTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
EST: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTG CTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
genomic: AGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgtta ... ttgttaacagCTTGGAAAGATGCTGTGGAAGAAGCATGTGAAAGCGGAATTGGTGTTATTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGGCAACCAAACCGTGTCGAGAGTTTGAGAATAGCAATGAGGAAAGCTGGAGATGATGTTAAAGGAGCAGCCTTGGTCAGTGATGCCTTCTTCCCATTTGgtaagtgttaatgtcatataaaatatatacaagacagaaattcattgtgtttgctgtgttataaagaggacatatagtggtggatggattagttattcct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gtggtgg