1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
CAGAACATGCATCTGGAAATGCCAAAGTTGGCATTGATTTGGAAGAAGGCATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatgatctaacacaagctttgttgtatatggtggcaacctatagtttgagcaaatagtgaactgacttttcattgctgtagtggagatttctct...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G07910.1 |
intron # | 11 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|151397877|gb|EV267750.1|EV267750
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|209718246|gb|BW657851.1|BW657851
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGCAAGGATGTCTCAACCCTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|192322913|gb|FK014844.1|FK014844
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|208169376|gb|GD970949.1|GD970949
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: TCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|254342219|gb|GR853356.1|GR853356
genomic: TCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGTAAGGATGTTTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTTTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|209700024|gb|BW656205.1|BW656205
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGCAAGGATGTCTCAACCCTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|193565080|gb|FK517983.1|FK517983
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTEST: gi|22522283|gb|BU081094.1|BU081094
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCT
EST: ATATGCAAGGATGTCTCAACCCTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|209721610|gb|BW671737.1|BW671737
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGCAAGGATGTCTCAACCCTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|214004268|gb|DB984742.1|DB984742
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGCAAGGATGTCTCAACCCTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|209728114|gb|BW655349.1|BW655349
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGCAAGGATGTCTCAACCCTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|298187661|gb|HO034810.1|HO034810
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGCAAGGATGTCTCAACCCTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGTEST: gi|254342218|gb|GR853355.1|GR853355
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
EST: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAA GTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
genomic: ATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatg ... ttcttttcagGTTATTTGCTCTTAAATATGCTGCAGATGCTGCATGCACTGTACTACGTGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CAGAACATGCATCTGGAAATGCCAAAGTTGGCATTGATTTGGAAGAAGGCATATGTAAGGATGTCTCAACCTTGAGCATTTGGGATCTCCATGTGACTAAgtaagctatgatctaacacaagctttgttgtatatggtggcaacctatagtttgagcaaatagtgaactgacttttcattgctgtagtggagatttctct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG