Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGGTATGAATTGTTGCACCAAATGGAGCCATATATTAACCAGgtttggaatcagctttgtctttagacactcattttttggtttctagaagtacatgtcatttataaaaacatttatcaagtggtacattgagggtgattaattggcaaacatttgagtcggtgaaaataaattgattcactccaggctagttgttttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G51810.1
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA18G51810.1 (Glycine max), 5'ss of exon 10
lower sequence: GRMZM5G872204_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 7
GGGTATGAATTGTTGCACCAAATGGAGCCATATATTAACCAGgtttggaatcagctttgtctttagacactcattttttggtttctagaagtacatgtcatttataaaaacatttatcaagtggtacattgagggtgattaattggcaaacatttgagtcggtgaaaataaattgattcactccaggctagttgttttgcag
|| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||     | | | ||  || |    | |    | ||  |   | |   |    || |  |||   ||||| ||   | | | || |||    |      |                                                           
GGATATGAACTATTGCATCAAATGGAGCCATATATTAATCAGgttacttttaaacatttcctctg--tattatgctgttaatgctttgctcttgtagttagatatcttaacatgtaaatattagcaccttgcatttctgctttc----------------------------------------------------------