Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCAGAAAATATTGTTACTCTTTATGATGTTCCCAACATCTGGCACATTCCTTTGCTTTTAAGAgtaagtcttcctctaaaactgctgaacttcaaatcatcttatatctgtatgtaccatttctcacaaattatcttcttctggtctatag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G19580.1
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207796312|gb|GD771453.1|GD771453
EST:     TTACTCTTTATGATGTTCCCAACATCTGGCACATTCCTTTGCTTTTAAGA                         GATCAGAAGGCTCACAAAGCAATGTTTAAAGTGCTGAACCTTCATGG
genomic: TTACTCTTTATGATGTTCCCAACATCTGGCACATTCCTTTGCTTTTAAGAgtaagtcttc ... tggtctatagGATCAGAAGGCTCACGAAGCAATGTTTAAAGTGCTGAACCTTCATGG
EST: gi|13479340|gb|BG508683.1|BG508683
EST:     TTACTCTTTATGATGTTCCCAACATCTGGCACATTCCTTTGCTTTTAAGA                         GATCAGAAAGCTCACGAAGCACTGTTTAAAGTGCTGAACCTTCATGG
genomic: TTACTCTTTATGATGTTCCCAACATCTGGCACATTCCTTTGCTTTTAAGAgtaagtcttc ... tggtctatagGATCAGAAGGCTCACGAAGCAATGTTTAAAGTGCTGAACCTTCATGG