Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   
14  
 5'  3'   
15  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAGTTAGAAATGTGACACTCAATGGTTTCCGCTGGGTATTGAGTCTTCTCCTTATGGAATTAATGACACATCTATTCTACTATAATGCCTTTGCTAATAGgtgagaacttagtattcaggaaagaaccacctgttatatttaatttttaaaccaattttattgtttggtagctgaaataatttcttaatcaattag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G41940.2
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|58019147|gb|CX705889.1|CX705889
EST:     NTTATGGAATTAATGACACATCTATTCTACTATAATGCCTTTGCTAATAG                         TGATTTGTGGAAGCACTTATCTCCTATGGACGTGTTCATCATTGGATATGG
genomic: CTTATGGAATTAATGACACATCTATTCTACTATAATGCCTTTGCTAATAGgtgagaactt ... aatcaattagTGATTTGTGGAAGCACTTATCTCCTATGGACGTGTTCATCATTGGATATGG
EST: gi|58018861|gb|CX705603.1|CX705603
EST:     CTTATGGAATTAATGACACATCTATTCTACTATAATGCCTTTGCTAATAG                         TGATTTGTGGAAGCACTTATCTCCTATGGACGTGTTCATCATTGGATATGG
genomic: CTTATGGAATTAATGACACATCTATTCTACTATAATGCCTTTGCTAATAGgtgagaactt ... aatcaattagTGATTTGTGGAAGCACTTATCTCCTATGGACGTGTTCATCATTGGATATGG