Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CGTTGATTTATGGGCATTCAATCAGAAGTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctctctctcacacacacacaccatagatatgcttttgatgtatggatgcatatcttagcacattaagaatgcgtaaatatgattttcaaatgcaatgaattttattctcttttcattatcagatgactgacctgctattgaattttctaatctgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G20360.2
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207811436|gb|GD783483.1|GD783483
EST:     GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAG                         TTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
genomic: GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctct ... taatctgcagTTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
EST: gi|254338644|gb|GR849955.1|GR849955
EST:     GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAG                         TTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAA
genomic: GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctct ... taatctgcagTTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAA
EST: gi|15662847|gb|BI700218.1|BI700218
EST:     GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAG                         TTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
genomic: GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctct ... taatctgcagTTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
EST: gi|193669758|gb|FK612358.1|FK612358
EST:     GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAG                         TTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
genomic: GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctct ... taatctgcagTTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
EST: gi|208271111|gb|GE066619.1|GE066619
EST:     GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAG                         TTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
genomic: GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctct ... taatctgcagTTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
EST: gi|193518779|gb|FK472752.1|FK472752
EST:     GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAG                         TTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
genomic: GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctct ... taatctgcagTTTGATATCCTATGGGATGCACTGTCTGGTCAGGAACACCTCCAACTCTTT
EST: gi|208188811|gb|GD981829.1|GD981829
EST:     GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAG                         TTTGATATCCTATGGGATGCA
genomic: GTTCTACTGGCATGTCAAACATTCGAAAGCTTATAGGAGTCTGTCCACAGgtgtttctct ... taatctgcagTTTGATATCCTATGGGATGCA