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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATATTCCACAAAAAGATGCCTCCAGAAGCTATTGATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtggttggctttaccccgctttctgtgttccgactaatttagtattgcattatgtatatcatcctgtatttctcccgccaatggatgttgttctttagaaaaacttgctcaacaattttagactaaattattttcctatgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G06850.1
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|10236817|gb|BE805705.1|BE805705
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
EST: gi|6482526|gb|AW201783.1|AW201783
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATNCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
EST: gi|15815079|gb|BI787354.1|BI787354
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
EST: gi|193456694|gb|FK423524.1|FK423524
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTG
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTG
EST: gi|17022657|gb|BM093691.1|BM093691
EST:     CTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
genomic: CTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
EST: gi|193557800|gb|FK513639.1|FK513639
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATTCCTTTCTTTGATGAAC
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACAT-CCTTTCTTTGATGAAC
EST: gi|254320416|gb|GR826865.1|GR826865
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
EST: gi|7590646|gb|AW706394.1|AW706394
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
EST: gi|10843146|gb|BF066460.1|BF066460
EST:     ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCG                         CTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT
genomic: ATCTTGCATCCCGGCTTTTGCAATACTCCCCAAGTCTCCGGTGCACTGCGgtaagtgtgg ... tcctatgcagCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTCTTTGATGAACTTCGTGAACCTAATGCT