Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATCTGCGGTGGCGAAGAACATGATGGAGAGTCTATCTGTGCCTACGTTCAGGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgtgattatgactatgaggcattgttttgtttgtgatgactataacatgaggctctatttgatgatgtgttctttctgtttgtttattag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G24830.2
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|6069878|gb|AW099474.1|AW099474
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|7926430|gb|AW832456.1|AW832456
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|19053677|gb|BM732344.1|BM732344
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|15664259|gb|BI701630.1|BI701630
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|22525077|gb|BU083888.1|BU083888
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|8282860|gb|BE020421.1|BE020421
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|7478035|gb|AW666112.1|AW666112
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|8283121|gb|BE020682.1|BE020682
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
EST: gi|208064294|gb|GD866676.1|GD866676
EST:     GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAG                         GTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA
genomic: GGGTGGGGTACCCTGTGACTACTGATGCGTTGGATGCCCTGTATGAGAAGgtatgaatgt ... tgtttattagGTGAAACCAAAGGGTGTGACAATGACGGCTATTTTGGCTAAGGCTGCTGCA