Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCCTTCAAGACTGTGGCTCTTTTCTCCAAAAAGAAGGCTGCACCTCCAAAAAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccccaagttatgtttgtttcaactgttatgtaacttatgttaattcaacctgtgttctttggaccatgtagttgaaggaagacaaatactagg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G33030.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|20497947|gb|BQ272877.1|BQ272877
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|23063929|gb|BU578703.1|BU578703
EST:     AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|8670480|gb|BE191587.1|BE191587
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209725349|gb|BW658247.1|BW658247
EST:     CTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: CTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209721017|gb|BW682496.1|BW682496
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|15285587|gb|BI469478.1|BI469478
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|20448919|gb|BQ253043.1|BQ253043
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209716659|gb|BW682220.1|BW682220
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|20448722|gb|BQ252846.1|BQ252846
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|120530661|gb|EH258794.1|EH258794
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|26057166|gb|CA800080.1|CA800080
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|21676857|gb|BQ629208.1|BQ629208
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|192309277|gb|FG999476.1|FG999476
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|23058509|gb|BU578319.1|BU578319
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209710533|gb|BW662069.1|BW662069
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|213593074|gb|DB969872.1|DB969872
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATTATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|31561938|gb|CD487776.1|CD487776
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|20448780|gb|BQ252904.1|BQ252904
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|27424688|gb|CA936208.1|CA936208
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209706244|gb|BW680659.1|BW680659
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTACTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209698465|gb|BW667262.1|BW667262
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209720872|gb|BW662598.1|BW662598
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|151412521|gb|EV282333.1|EV282333
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|19936492|gb|BQ080889.1|BQ080889
EST:     NNNTTCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|19453008|gb|BM954418.1|BM954418
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|20076089|gb|BQ094872.1|BQ094872
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|15337851|gb|BI498507.1|BI498507
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|15200139|gb|BI424193.1|BI424193
EST:     TGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: TGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209718591|gb|BW662696.1|BW662696
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|23728211|gb|BU762151.1|BU762151
EST:     TGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: TGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|213591516|gb|DB959946.1|DB959946
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|23050476|gb|BU577005.1|BU577005
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|213607347|gb|DB957155.1|DB957155
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|120534112|gb|EH262245.1|EH262245
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGTCCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|213594884|gb|DB971771.1|DB971771
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|120531346|gb|EH259479.1|EH259479
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|213591356|gb|DB973817.1|DB973817
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209722542|gb|BW682640.1|BW682640
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|213610458|gb|DB958777.1|DB958777
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209705308|gb|BW667979.1|BW667979
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|298193915|gb|HO040563.1|HO040563
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|120530617|gb|EH258750.1|EH258750
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|209725348|gb|BW658246.1|BW658246
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|213596464|gb|DB960281.1|DB960281
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: gi|15204669|gb|BI427437.1|BI427437
EST:     NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG                         GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TCCTTCAAGACTGTGGCTCTTTTCTCCAAAAAGAAGGCTGCACCTCCAAAAAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccccaagttatgtttgtttcaactgttatgtaacttatgttaattcaacctgtgttctttggaccatgtagttgaaggaagacaaatactagg

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CTGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGCTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cccccaa