1 5' 3' |
AACTGCAAACAGGTCTATTCTGGTCATTGAAGACATCGATTGCAGCGTCGATCTGCCAGGGCGTAGGCATGGAGATGGCCGTAAACAACCTGATGTGCAGgttggtgatcttcttatgtatcttcctctcctattttatcctataagtacatatttaattgctataatatgttatgcctgttgaattgcaaagtaccttg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G24690.1 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATCTGCCAGGGCGTAGGCATGGAGATGGCCGTAAACAACCTGATGTGCAG TTGAGTTTGTGTGGATTACTCAACTTCATAGATGGGCTATGGTCGAGTTGTEST: gi|16996129|gb|BM085501.1|BM085501
genomic: ATCTGCCAGGGCGTAGGCATGGAGATGGCCGTAAACAACCTGATGTGCAGgttggtgatc ... atggatgcagTTGAGTTTGTGTGGATTACTCAACTTCATAGATGGGCTATGGTCGAGTTGT
EST: GAGATGGCCGTAAACAACCTGATGTGCAG TTGAGTTTGTGTGGATTACTCAACTTCATAGATGGGCTATGGTCGAGTTGT
genomic: GAGATGGCCGTAAACAACCTGATGTGCAGgttggtgatc ... atggatgcagTTGAGTTTGTGTGGATTACTCAACTTCATAGATGGGCTATGGTCGAGTTGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AACTGCAAACAGGTCTATTCTGGTCATTGAAGACATCGATTGCAGCGTCGATCTGCCAGGGCGTAGGCATGGAGATGGCCGTAAACAACCTGATGTGCAGgttggtgatcttcttatgtatcttcctctcctattttatcctataagtacatatttaattgctataatatgttatgcctgttgaattgcaaagtaccttg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -cttcctc