Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAGGGTAGGCTGTTACGGTTTGGTTTGGTGGTTATTTGATTGGTGTGCATCCATGTTAAGCTAGTGGCGATCGGATCCAGCTACAGCCTACAACCTACAGgtgcggattcttgtttttctttttcttccagatctttttgaatccaccagcatcttagtcttagggtttttgtttccagcatagatgtttgtttcttctgtgtgttgttgtcgattattattattgaaaaacaagaaatttattgatggattactactggttttgtgacttactag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G36540.3
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254319588|gb|GR829100.1|GR829100
EST:     CTACAACCTACAG                         TTTTGGTTTGGTTTGCTTGATTGAAGATCAAGGAAGGAAGATGTTGGGTGT
genomic: CTACAACCTACAGgtgcggattc ... gacttactagTTTTGGTTTGGTTTGCTTGATTGAAGATCAAGGAAGGAAGATGTTGGGTGT
EST: gi|193454452|gb|FK418751.1|FK418751
EST:     CCATGTTAAGCTAGTGGCGATCGGATCCAGCTACAGCCTACAACCTACAG                         TTTTGGTTTGGTTTGCTTGATTGAAGATCAAGGAAGGAAGATGTTGGGTGT
genomic: CCATGTTAAGCTAGTGGCGATCGGATCCAGCTACAGCCTACAACCTACAGgtgcggattc ... gacttactagTTTTGGTTTGGTTTGCTTGATTGAAGATCAAGGAAGGAAGATGTTGGGTGT
EST: gi|151404289|gb|EV274099.1|EV274099
EST:     CCATGTTAAGCTAGTGGCGATCGGATCCAGCTACAGCCTACAACCTACAG                         TTTTGGTTTGGTTTGCTTGATTGAAGATCAAGGAAGGAAGATGTTGGGTGT
genomic: CCATGTTAAGCTAGTGGCGATCGGATCCAGCTACAGCCTACAACCTACAGgtgcggattc ... gacttactagTTTTGGTTTGGTTTGCTTGATTGAAGATCAAGGAAGGAAGATGTTGGGTGT