Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|22928993|gb|BU546132.1|BU546132EST: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATG GTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
genomic: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagt ... attatctcagGTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
EST:
gi|7924578|gb|AW830604.1|AW830604EST: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATG GTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
genomic: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagt ... attatctcagGTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
EST:
gi|298199186|gb|HO042549.1|HO042549EST: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATG GTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
genomic: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagt ... attatctcagGTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
EST:
gi|24205490|gb|BU964743.1|BU964743EST: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATG GTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTA
genomic: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagt ... attatctcagGTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTA
EST:
gi|193612976|gb|FK565079.1|FK565079EST: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATG GTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
genomic: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagt ... attatctcagGTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
EST:
gi|22927386|gb|BU544525.1|BU544525EST: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATG GTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
genomic: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagt ... attatctcagGTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
EST:
gi|208163744|gb|GD963272.1|GD963272EST: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATG GTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
genomic: ATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagt ... attatctcagGTGACTCCTAATCTCTATGGAAATCTAGTGGCTAATACGGCAGCTGGAATT
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
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ACATGTAGCTACCAAATATCCTGGTATCAAGTACAACGAGATTATTGTCGATAATTGCTGCATGCAACTTGTCTCCAAACCAGAGCAGTTCGATGTTATGgttagttagttaattggttactatagtatcatcttcccttccctttccaatctaaatctcttctcgtgttattatctcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCA
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