Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCACATGAAGTCCTTGGGATGCCTGCTTTATCTCCTACAATGgtaagcttgggtaaacaatttttctctttgttttatctctattccgtttagggcttccatgtactgttgtttgctcatcttttggtttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G34480.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA10G34480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: Vv13s0074g00150.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
--------TCACATGAAGTCCTTGGGATGCCTGCTTTATCTCCTACAATGgtaagct---tgggtaaacaatttttctctttgttttatctctattccgtttagggcttccatgtactgttgtttgctcatctttt-ggtttcag----------------------
        || |||   |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   |||| ||  ||||  |   ||||    || | |  |   ||| | | ||  || | || || ||||| ||     | |||| ||                       
AGCTTCCTTCGCATATGGTCCTTGGAATGCCAGCTTTATCACCTACAATGgtaagatatatggggaaggaattaat---tttgaaacatttgttgttttttttgtggttggatcttctcttttttgcacaaaagctaggttgcattcttgtgtgctctcttgtgcag