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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTGTCGGAGTCGGAGATCCGCCATCTCTGTGCCGCTTCCAGAGAGATTTTCTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctgttgtcttcttctttttgaactgcatattgtcatttttgttgcttgttagttttaaccctagcatcaccccctcccgaaacggcgtcgttt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G30970.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA10G30970.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: Vv14s0036g00370.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 1
CTGTCGGAGTCGGAGATCCGCCATCTCTGTGCCGCTTCCAGAGAGATTTTCTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttc-tgttgtcttcttctttttgaactgcatattgtcatttttgttgcttgttagttttaaccctagcatcaccccctcccgaaacggcgtcgttt
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TTATCGGAGTCAGAGATCCGGCAACTCTGTGTAGTTTCTAGGGAGATTTTCTTAAAACAGCCCAATTTGTTGGAGCTATGTGCACCCATCAAGATTTGCGgtacttttgtgaaacccaatttttttttctttatgtctttttttttctctttccttttgggtgaagttgagtcatgagtagggatt-aaattgcttagttt
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|120532806|gb|EH260939.1|EH260939
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208175367|gb|GD976426.1|GD976426
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208150587|gb|GD949456.1|GD949456
EST:     TGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTAGACG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGT
genomic: TGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTT-G-CGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGT
EST: gi|213596008|gb|DB956016.1|DB956016
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|6915649|gb|AW397179.1|AW397179
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193509509|gb|FK470683.1|FK470683
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGTG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|254314304|gb|GR824545.1|GR824545
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|213589565|gb|DB965809.1|DB965809
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208240166|gb|GE042304.1|GE042304
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|209726519|gb|BW658086.1|BW658086
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|207705090|gb|GD684729.1|GD684729
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193730183|gb|FK667355.1|FK667355
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193574250|gb|FK527887.1|FK527887
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|213619893|gb|DB971152.1|DB971152
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193422253|gb|FK391476.1|FK391476
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208094349|gb|GD894914.1|GD894914
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|207839706|gb|GD811817.1|GD811817
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208077817|gb|GD875251.1|GD875251
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208332598|gb|GE129045.1|GE129045
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208249190|gb|GE050385.1|GE050385
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208299946|gb|GE098059.1|GE098059
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTNTAGTATGGT
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTG-AGTATGGT
EST: gi|193571005|gb|FK528582.1|FK528582
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGG
EST: gi|208317885|gb|GE117100.1|GE117100
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193626372|gb|FK577048.1|FK577048
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208335129|gb|GE129252.1|GE129252
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|16346581|gb|BI972176.1|BI972176
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208288670|gb|GE088813.1|GE088813
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193324926|gb|FK290210.1|FK290210
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208069591|gb|GD872957.1|GD872957
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208054572|gb|GD850215.1|GD850215
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|207823178|gb|GD794469.1|GD794469
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193684151|gb|FK621791.1|FK621791
EST:     TTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGACTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: TTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAG-CTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208200549|gb|GD995164.1|GD995164
EST:     GCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGACAACCCAATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: GCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAG-C-ACCC-ATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193400396|gb|FK366637.1|FK366637
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|7926167|gb|AW832193.1|AW832193
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208210939|gb|GE012658.1|GE012658
EST:     CTTGCAGCAACCT-ATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193337882|gb|FK305021.1|FK305021
EST:     AATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: AATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208296518|gb|GE094028.1|GE094028
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|192320108|gb|FK014178.1|FK014178
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208067069|gb|GD862637.1|GD862637
EST:     TTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: TTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCC-ATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|208084781|gb|GD882729.1|GD882729
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|207701384|gb|GD683343.1|GD683343
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATTCTTTTAAGGTCTTTTTGAGTATGG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGAT-CTTTTAAGG-CTTTTTGAGTATGG
EST: gi|207806871|gb|GD778452.1|GD778452
EST:     CCATTAAGATTTGGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATTCTTTTAAGGTCTTTTTGAGTATG
genomic: CCATTAAGATTT-GCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGA-TCTTTTAAGG-CTTTTTGAGTATG
EST: gi|208133185|gb|GD932126.1|GD932126
EST:     CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCG                         GTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
genomic: CTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctg ... gatctctcagGTGATGTACATGGTCAATATTCTGATCTTTTAAGGCTTTTTGAGTATGGTG
EST: gi|193627940|gb|FK573208.1|FK573208
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CTGTCGGAGTCGGAGATCCGCCATCTCTGTGCCGCTTCCAGAGAGATTTTCTTGCAGCAACCTAATTTGTTGGAGCTTGAAGCACCCATTAAGATTTGCGgtaatttctgttgtcttcttctttttgaactgcatattgtcatttttgttgcttgttagttttaaccctagcatcaccccctcccgaaacggcgtcgttt

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - caccccc