Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCACTCCCATTAACAGCAACCATGGTGCAGAGGCTCACTTATCGCAAGCGGCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttccactttgttctttttttatttgttttgtgtttttttcttcctaattgtgtattttttcattctgatctcaattatgtccattcagttgctgtcaaaaagtggttttgttagttctgtctggtgttttaactgacttttactaatgggcatgtctcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G37360.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208210860|gb|GE012621.1|GE012621
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCCA                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|5175487|gb|AI759820.1|AI759820
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|21600798|gb|BQ611129.1|BQ611129
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|33388640|gb|CA851847.1|CA851847
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|26059008|gb|CA801922.1|CA801922
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|41146454|gb|CK606665.1|CK606665
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|193577122|gb|FK536569.1|FK536569
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|151395042|gb|EV264913.1|EV264913
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|192328957|gb|FK019684.1|FK019684
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAGGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|16104974|gb|BI892714.1|BI892714
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|192309351|gb|FK000559.1|FK000559
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|254349282|gb|GR860080.1|GR860080
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|192328154|gb|FK020415.1|FK020415
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|193538075|gb|FK494606.1|FK494606
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACTGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
EST: gi|208215979|gb|GE014697.1|GE014697
EST:     GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAACACCGGGTTGTTAAGACCCCTG                         GAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT
genomic: GCATAGTTATGCTACCAAATCCAACCAGCACCGGGTTGTTAAGACCCCTGgtatgtttcc ... catgtctcagGAGGGAAGTTGGTGTACCAGACCACTAAGAAGAGAGCAAGTGGACCTAAGT