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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTGAATCGGTTTCGTCTTCTTCGTTTTTCTTCAAAATCCTCGTGACAGATCTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgttttatgaatccaaccatagctggaaaaaaaaagttgactcctttttttcccttttaccttcaattagcttttacacttttatgggtatctgtgt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G22620.5
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|9565669|gb|BE475178.1|BE475178
EST:     CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGG                         AGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
genomic: CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgtttta ... attgtaacagAGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
EST: gi|37995426|gb|CF807015.1|CF807015
EST:     TTCAGACATTGCATGCATATGGG                         AGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
genomic: TTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgtttta ... attgtaacagAGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
EST: gi|15199752|gb|BI423992.1|BI423992
EST:     CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGG                         AGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
genomic: CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgtttta ... attgtaacagAGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
EST: gi|192324319|gb|FK018295.1|FK018295
EST:     TTCAGACATTGCATGCATAT--G                         -G--GTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
genomic: TTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgtttta ... attgtaacagAGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
EST: gi|37994146|gb|CF805892.1|CF805892
EST:     CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGG                         AGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
genomic: CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgtttta ... attgtaacagAGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
EST: gi|192297127|gb|FG988223.1|FG988223
EST:     CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGG                         AGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
genomic: CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgtttta ... attgtaacagAGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
EST: gi|37995362|gb|CF806951.1|CF806951
EST:     CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATAT--G                         -G--GTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG
genomic: CTAATCTAATCAGCCTTTTGGGGGTGTTTCAGACATTGCATGCATATGGGgtatgtttta ... attgtaacagAGCAGTGGTTGTGTTGGATGCTATAAAAGGCCTTCACTGAGTCCCACAGTG