1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
TAAACACCCTGTTGCAATCACTGGTGTTATTGGCTTCATTGGGACAAAAAGATCGCCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAGgtcatataacttatacatattatttctttgtatgcttatcacatatacaaggttttaaattgtggtcgcagtttgttgcaatctttggtattgcgataaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G21030.1 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GATCGCCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAG GAAATGGTGGAGTGGGAGCACAAGAGTAAAGTACCTGGAAAGATGCATGEST: gi|193658643|gb|FK604632.1|FK604632
genomic: GATCGCCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAGgtcatataac ... ctgaccttagGAAATGGTGGAGTGGGAGCACAAGAGTAAAGTACCTGGAAAGATGCATG
EST: CCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAG GAAATGGTGGAGTGGGAGCACAAGAGTAAAGTACCTGGAAAGATGCATGCGEST: gi|6667962|gb|AW279413.1|AW279413
genomic: CCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAGgtcatataac ... ctgaccttagGAAATGGTGGAGTGGGAGCACAAGAGTAAAGTACCTGGAAAGATGCATGCG
EST: GATCGCCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAG GAAATGGTGGAGTGGGAGCACAAGAGTAAAGTACCTGGAAAGATGCATGCG
genomic: GATCGCCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAGgtcatataac ... ctgaccttagGAAATGGTGGAGTGGGAGCACAAGAGTAAAGTACCTGGAAAGATGCATGCG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TAAACACCCTGTTGCAATCACTGGTGTTATTGGCTTCATTGGGACAAAAAGATCGCCTTTTGTTGCAATTAGGGCTGATATGGATGCTCTTCCCATGCAGgtcatataacttatacatattatttctttgtatgcttatcacatatacaaggttttaaattgtggtcgcagtttgttgcaatctttggtattgcgataaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT