Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACTTCAATGGTGGAACCAGATTGATGACTCAGATCAATGGCAGAGAGGCACTTACTATGCCCTTTGTGCCGCTTATACGTTGGTCTCCTTTGTTGCCCTGgttggtattcttctttcattttcatggaaaatcttgagccttgagaaaaatgaacaagttttttttttcattatggccttggatacgcattgtttgtttt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G07670.2
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151393599|gb|EV263474.1|EV263474
EST:     CTTACTATGCCCTTTGTGCCGCTTATACGTTGGTCTCCTTTGTTGCCCTG                         GTGCAACTGGTACGAATTCAAAGGAGGGTACCTGAGTATGGGTGGACAACG
genomic: CTTACTATGCCCTTTGTGCCGCTTATACGTTGGTCTCCTTTGTTGCCCTGgttggtattc ... ttattctcagGTGCAACTGGTACGAATTCAAAGGAGGGTACCTGAGTATGGGTGGACAACG
EST: gi|163926925|gb|EH038506.1|EH038506
EST:     CCTACTATGCCCTTTGTGCCGCTTATACGTTGGTCTCCTTTGTTGCCCTG                         GTGCAACTGGTACGAATTCAAAGGAGGGTACCTGAGTATGGGTGGACAACG
genomic: CTTACTATGCCCTTTGTGCCGCTTATACGTTGGTCTCCTTTGTTGCCCTGgttggtattc ... ttattctcagGTGCAACTGGTACGAATTCAAAGGAGGGTACCTGAGTATGGGTGGACAACG
EST: gi|192307419|gb|FK000761.1|FK000761
EST:     CTTACTATGCCCTTTGTGCCGCTTATACGTTGGTCTCCTTTGTTGCCCTG                         GTGCAACTGGTACGAATTCAAAGGAGGGTACCTGAGTATGGGTGGACAACG
genomic: CTTACTATGCCCTTTGTGCCGCTTATACGTTGGTCTCCTTTGTTGCCCTGgttggtattc ... ttattctcagGTGCAACTGGTACGAATTCAAAGGAGGGTACCTGAGTATGGGTGGACAACG