Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|6719449|gb|AW307096.1|AW307096EST: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAG AGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAGgtataatgct ... gcttctgcagAGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
EST:
gi|8282644|gb|BE020205.1|BE020205EST: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAG AGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAGgtataatgct ... gcttctgcagAGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
EST:
gi|9259204|gb|BE347351.1|BE347351EST: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAG AGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAGgtataatgct ... gcttctgcagAGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
EST:
gi|21602572|gb|BQ612903.1|BQ612903EST: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAG AGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAGgtataatgct ... gcttctgcagAGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
EST:
gi|4295836|gb|AI442389.1|AI442389EST: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAG AGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAGgtataatgct ... gcttctgcagAGCCAATGCACAGCAGCCAAAACTTTTTGTTGGAATGATTCTCATCCTCAT
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
TCTTTGATGGTTATGCACATCTCTCCTCTGGTCTTGCCTGTGGCTTGGCTGGCCTTTCTGCTGGCATGGCTATTGGTATTGTCGGTGATGCTGGTGTTAGgtataatgcttttttactttgtttttcatatatgatttgtttcttatttcttgatgtgtttaaggtcttgttgaattgcaatattgcatagtgacattca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG