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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgtttttggtattcttacaagtttgctgcttttgacattttcaactatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaatgtcacaat...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G09370.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA02G09370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: Vv08s0007g08370.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 1
GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgtttttggtattcttacaagtttgctgcttttgacattttcaactatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaatgtcacaat---
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GGCCGCTAGGGTTCCAAAGAAGGTTTTGCAGTTTGCTGGAATCGAGGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGTTCAACCAAAACCCTCGGAAATTTCGTCAAGgtttgatct-atttctttgtctgctttgttgatttggatttgattcgaaaatgtttctacgtttatcttcagatttaagttt--atttgagtgaattaatctc

upper sequence: GLYMA02G09370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: PP1S411_32V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 1
GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgt--ttttggtattcttacaagtttgctgcttttgacattttcaactatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaatgtcacaat
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AGCCGCCCGAGTGCCCAAGAAGGTCCTCCAGTTCGCCGGTATTGAAGATGTATTCACTTCATCACGCGGCTCCACCAAAACTCTTGGAAATTTCGTTAAGgtgtgtacctctgtctctccttttagagtcgtaaaggtgattaattcg-cgctagtccaaatttctagggtttatcgacgggtcttatgggattgtattaa-

upper sequence: GLYMA02G09370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: PP1S10_190V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 1
GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgtttttggtattcttacaagtttgctgcttt-tgacattttcaac-tatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaatgtcacaat
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CGCCGCCCGCGTGCCCAAGAAGGTTTTGCAGTTTGCCGGTATTGAGGATGTGTTCACCTCTTCCCGCGGCTCCACCAAGACCCTCGGTAACTTCGTGAAGgtgagctggtttcattcggaatactcttcgtcttagtgatgaagtaggcctaatttgattgtaatgctgtcgatagtatgttgagcattgacttgtgatg--

upper sequence: GLYMA02G09370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: PP1S400_15V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 1
GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgtttttggtattcttacaa-gtttgctgcttttgacattttcaactatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaat-gtcacaat--
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CGCTGCACGCGTGCCCAAGAAGGTTTTGCAGTTCGCCGGTATTGAGGATGTTTTCACCTCTTCCCGCGGATCCACCAAGACCCTCGGTAATTTCGTGAAGgtgagc---aaatttgcttagggcgtgtgatgcttgtgtgttaatgtactgt-attaaatcctgattagggtttctcgattcggaactgaaattgtcctagtct

upper sequence: GLYMA02G09370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: EFJ35105 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 1
GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgtttttggtattcttacaagtttgctgcttttgacattttcaactatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaatgtcacaat
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TGCCGCTCGCGTCCCCAAAAAGGTGCTCCAGTTTGCCGGGATCGAGGACGTTTTCACCTCGTCGCGCGGATCGACCAAGACTCTGGGAAACTTCGTCAAGgtgaggatt-gatctgatcgttcttctttcactctcgacgagtt----tttcttggt--ttttggcag--------------------------------

upper sequence: GLYMA02G09370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: EFJ24057 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 1
GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgtttttggtattcttacaagtttgctgcttttgacattttcaactatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaatgtcacaat
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TGCCGCTCGCGTCCCCAAGAAGGTGCTCCAGTTTGCCGGGATCGAGGATGTTTTCACCTCGTCGCGCGGATCGACCAAGACACTCGGCAACTTCGTCAAGgtgaggattgg----tctgatcgttctttcattctcgacgagtt----tttcttggt--ctttcgcag--------------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207752027|gb|GD723138.1|GD723138
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|120494894|gb|EH223061.1|EH223061
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193434533|gb|FK401511.1|FK401511
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|207718297|gb|GD699211.1|GD699211
EST:     CTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: CTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193561016|gb|FK522045.1|FK522045
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|207842971|gb|GD815537.1|GD815537
EST:     CCTCCTCCAGGGGATTCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: CCTCCTCCAGGGGA-TCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208173261|gb|GD971586.1|GD971586
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGAGGATCCACCAAGACCCTCGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193377520|gb|FK339280.1|FK339280
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGAGGATCCACCAAGACCCTCGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|31306666|gb|CD391869.1|CD391869
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCCAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCCGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|254319696|gb|GR830828.1|GR830828
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193672163|gb|FK617567.1|FK617567
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208210934|gb|GE012653.1|GE012653
EST:     CCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: CCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208325269|gb|GE124061.1|GE124061
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193377780|gb|FK341472.1|FK341472
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATT
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATT
EST: gi|208152628|gb|GD949131.1|GD949131
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATT
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATT
EST: gi|207787527|gb|GD759323.1|GD759323
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193546012|gb|FK500375.1|FK500375
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193558076|gb|FK514853.1|FK514853
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|207777001|gb|GD747844.1|GD747844
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208313553|gb|GE116501.1|GE116501
EST:     AGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: AGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193431701|gb|FK395207.1|FK395207
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTAC-TTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193682148|gb|FK621272.1|FK621272
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208055486|gb|GD855029.1|GD855029
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193549517|gb|FK510558.1|FK510558
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193398120|gb|FK361242.1|FK361242
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGAGGATCCACCAAGACCCTCGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208115625|gb|GD909442.1|GD909442
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGTCTTGTATGAAAACCTAATGGATT
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTG-CTTG-ATGAAAACCTA-TGGATT
EST: gi|208161918|gb|GD959275.1|GD959275
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACTCCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193539842|gb|FK493828.1|FK493828
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208296861|gb|GE095729.1|GE095729
EST:     ACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: ACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|18039229|gb|BM307523.1|BM307523
EST:     TTTCACCTCCCTC-AGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGA
genomic: TTTCACCTCC-TCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGA
EST: gi|208312627|gb|GE112089.1|GE112089
EST:     AGGGGATCCACCAAGACCCTTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: AGGGGATCCACCAAGACCC-TTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|4397589|gb|AI496586.1|AI496586
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208044316|gb|GD839284.1|GD839284
EST:     TTCTACCTCCTTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTC-ACCTCC-TCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|208277375|gb|GE081200.1|GE081200
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGGTGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|207782172|gb|GD753743.1|GD753743
EST:     TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
genomic: TTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgttttt ... ttatttacagGCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
EST: gi|193588461|gb|FK544112.1|FK544112
EST:     CCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAG                         GCTACTTTTGATTGCTTGATGAAAACCTATGGATTCCTGACACCAGAATTC
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GGCGGCTAGGGTTCCCAAGAAGGTGCTGCAGTTTGCTGGTATTGATGATGTTTTCACCTCCTCCAGGGGATCCACCAAGACCCTTGGCAACTTCGTTAAGgtttgtttttggtattcttacaagtttgctgcttttgacattttcaactatcatgaaaatttttatggacgaattaaggttgtaattccaatgtcacaat

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