Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TATCGGCCTCAGCAGACGACGTCGTTGTGCTCTCTGAAGATAACTTCGAGAAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttaccaatcttctcgatctctttctctctgtttctatcaactatttcttattccatcgttactttgattttttgaaatcgttatcaggtagggtt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G01750.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA02G01750.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: AT2G47470.3 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 1
TATCGGCCTCAGCAGACGACGTCGTTGTGCTCTCTGAAGATAACTTCGAGAAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttaccaatcttctcgatctcttt-ctctctgtttctatcaacta-tttcttattccatcgttactttgattttttgaaatcgttatcaggtagggtt
| || |||  ||| ||||| || |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||| | || | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |  ||||  |||| ||     | |  ||  |||  |||    | | |  |  || |    |  |||||| | |       ||  || ||     | 
TTTCAGCCGTAGCTGACGATGTGGTTGTTTTGACTGACGATAGCTTCGAAAAGGAAGTTGGTAAAGATAAAGGAGCTCTCGTCGAGTTTTACGCTCCCTGgtatggt-tcaattctctcaattcggatgcgatcctttttgatctgtaaatcttctggtcgagaaatgttttgatctgtgattgcagtcttctggattaat-
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193525146|gb|FK479195.1|FK479195
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGACAAAAAGCTTGCTCCAGAATATAGAAAAGACTTGGTAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTG-CAAAAAGCTTGCTCCAGAATAT-GAAAAG-CTTGGTAG
EST: gi|193718516|gb|FK649084.1|FK649084
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTA
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTA
EST: gi|208201719|gb|GD996166.1|GD996166
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAACATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193350926|gb|FK314206.1|FK314206
EST:     AAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193620073|gb|FK569088.1|FK569088
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGG
EST: gi|207718850|gb|GD700198.1|GD700198
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208324590|gb|GE120963.1|GE120963
EST:     CTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: CTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193398411|gb|FK362947.1|FK362947
EST:     AAGGAAGTTGGCCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|193641401|gb|FK589007.1|FK589007
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCA
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTG-TGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCA
EST: gi|193589978|gb|FK544334.1|FK544334
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208263862|gb|GE065270.1|GE065270
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAG
EST: gi|208152626|gb|GD949129.1|GD949129
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCT
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCT
EST: gi|193494709|gb|FK458903.1|FK458903
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193431243|gb|FK396849.1|FK396849
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|208221320|gb|GE017266.1|GE017266
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|193622648|gb|FK570554.1|FK570554
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTGGTAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|192333634|gb|FK026879.1|FK026879
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193466612|gb|FK432061.1|FK432061
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193481517|gb|FK446440.1|FK446440
EST:     TTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: TTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208052028|gb|GD853439.1|GD853439
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193665968|gb|FK611355.1|FK611355
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|193382421|gb|FK349006.1|FK349006
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193475513|gb|FK440292.1|FK440292
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208297750|gb|GE092853.1|GE092853
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208061547|gb|GD859261.1|GD859261
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208287580|gb|GE081716.1|GE081716
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|163921267|gb|EH038909.1|EH038909
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTAGCTCCAGAATATGAAAAGCTAGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193627766|gb|FK577948.1|FK577948
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|207806760|gb|GD776577.1|GD776577
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|193404500|gb|FK369525.1|FK369525
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|207708380|gb|GD691378.1|GD691378
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAG
EST: gi|207758702|gb|GD728748.1|GD728748
EST:     TTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: TTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193521591|gb|FK477712.1|FK477712
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208180185|gb|GD973684.1|GD973684
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193429912|gb|FK395560.1|FK395560
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATAT
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATAT
EST: gi|193704830|gb|FK645692.1|FK645692
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|208192570|gb|GD994170.1|GD994170
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|207697573|gb|GD679084.1|GD679084
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGCAAAG
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAG
EST: gi|207759728|gb|GD734843.1|GD734843
EST:     TTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
genomic: TTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCTCCAGAATATGAAAAGCTTGGTAGCAG
EST: gi|193561381|gb|FK518500.1|FK518500
EST:     AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTG                         GTGTGGACACTGACAAAAAGCTTGCTCCAGAATATAGAAAAGCTTGGTAGC
genomic: AAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttacc ... gttgtaatagGTGTGGACACTG-CAAAAAGCTTGCTCCAGAATAT-GAAAAGCTTGGTAGC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TATCGGCCTCAGCAGACGACGTCGTTGTGCTCTCTGAAGATAACTTCGAGAAGGAAGTTGGTCAGGACAGAGGAGCTCTCGTTGAGTTCTATGCTCCTTGgtaacttaccaatcttctcgatctctttctctctgtttctatcaactatttcttattccatcgttactttgattttttgaaatcgttatcaggtagggtt

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGCT