Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGCGCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctctaccttctttgctattctgcttatgtttttttgttcgtttgtaatttgtttttgttttcattagatctgatgcctgaattgaacgattat...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA01G41620.2
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|8827482|gb|BE211212.1|BE211212
EST:     GGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: GGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
EST: gi|15287650|gb|BI471541.1|BI471541
EST:     GTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: GTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
EST: gi|193429363|gb|FK398511.1|FK398511
EST:     GGCGCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: GGCGCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
EST: gi|23729345|gb|BU762755.1|BU762755
EST:     AGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: AGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
EST: gi|7796785|gb|AW782179.1|AW782179
EST:     GCGCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: GCGCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
EST: gi|193354576|gb|FK319084.1|FK319084
EST:     GCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: GCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
EST: gi|207810578|gb|GD781687.1|GD781687
EST:     GCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTTTGGTTGTACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: GCGGGTGAGGTAGAACCCTTCCACTG--TGG-TG-ACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
EST: gi|14258879|gb|BG881787.1|BG881787
EST:     GGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGG                         GTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA
genomic: GGTGAGGTAGAACCCTTCCACTGTGGTGACTCTGCGATGGgtactgcctc ... ttggcaatagGTGCCTACAAGTATGTTTCAGAGCTATGGCGCAAGAAGCAGTCTGATGTCA