Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATGGAAGTCACCACATTCAATCGAAGCACTTTCAGCGATGCTGCTGACTTTCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagttttacttttatctgatttatgttattatcattacatcacactaacttttcgaatctaaaatttcaaacttttctgcttcccttttttgtt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA01G40650.4
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|27809063|gb|CB063485.1|CB063485
EST:     TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG                         GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
genomic: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
EST: gi|7693502|gb|AW761594.1|AW761594
EST:     TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG                         GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
genomic: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
EST: gi|20813512|gb|BQ297990.1|BQ297990
EST:     TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG                         GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
genomic: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
EST: gi|20811609|gb|BQ296087.1|BQ296087
EST:     TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG                         GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
genomic: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG