1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
GGACGCCAAGGGCGGCTCGCCGTGGGGCGCCGGCACCCTGGCCGGCCCTGACGGCTCCCGGCAGCCCTCGGAAGTGGAGCTGGAGGCGCTCCGTGTGCAGgtgggtgacgcagtaacagcagcaggcaggagcgcaagagtgtagtgtgcggtatcactgggttctcatgtgcacccagatttgctgggcttggtcacgt...
species | Chlamydomonas reinhardtii |
transcript | EDP08043 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ACGGCTCCCGGCAGCCCTCGGAAGTGGAGCTGGAGGCGCTCCGTGTGCAG GCCAAGCACTTCGGCGGCATCGCCAAGAAGCTCGCGGCGTGAGCGGAGCACEST: gi|161815931|gb|FC099895.1|FC099895
genomic: ACGGCTCCCGGCAGCCCTCGGAAGTGGAGCTGGAGGCGCTCCGTGTGCAGgtgggtgacg ... gtatctgcagGCCAAGCACTTCGGCGGCATCGCCAAGAAACTCGCGGCGTGAGCGGAGCAC
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atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGACGCCAAGGGCGGCTCGCCGTGGGGCGCCGGCACCCTGGCCGGCCCTGACGGCTCCCGGCAGCCCTCGGAAGTGGAGCTGGAGGCGCTCCGTGTGCAGgtgggtgacgcagtaacagcagcaggcaggagcgcaagagtgtagtgtgcggtatcactgggttctcatgtgcacccagatttgctgggcttggtcacgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aacagca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gagtgta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gtgtgcg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgggttc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - catgtgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -acccaga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgggctt