1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
ATGGTGTGGCGAGCCTCCAAGACCCTCGGCTGTGGAGTGGGGCTGGGAGAGGTGCCGTGGCCGAGCATGCCAGGTGGCGTGGTGGGCTGCAAGgtgcgtgcggctcgggggtttaccgttctgtgggggtgcgtgcacactgcacagccaccccaccccatcccatcctcgctcatatgccgttcttcaaggg...
species | Chlamydomonas reinhardtii |
transcript | EDP09166 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGGGAGAGGTGCCGTGGCCGAGCATGCCAGGTGGCGTGGTGGGCTGCAAG ATTGTGGTGTGTCGCTACTCATCGGGTGCGCTGGCCAGTGACACCCTCTGG
genomic: TGGGAGAGGTGCCGTGGCCGAGCATGCCAGGTGGCGTGGTGGGCTGCAAGgtgcgtgcgg ... tgcgacgcagATTGTGGTGTGTCGCTACTCATCGGGTGCGCTGGCCAGTGACACCCTCTGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATGGTGTGGCGAGCCTCCAAGACCCTCGGCTGTGGAGTGGGGCTGGGAGAGGTGCCGTGGCCGAGCATGCCAGGTGGCGTGGTGGGCTGCAAGgtgcgtgcggctcgggggtttaccgttctgtgggggtgcgtgcacactgcacagccaccccaccccatcccatcctcgctcatatgccgttcttcaaggg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgcgtgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgcggct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ggggttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gttctgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -cagccac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ctcatat