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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CGACTCCCCAAACTGCGTGGAGCCCGCGCCGGCGGCAGAGGGGCAGCCCGACCTGCGACTGGCGCCGTGTGACCGCAGCGACAGCCAGCTGTTCTTCCTGgtggcgccggagggtgagtggcggcatgcagtgtgcgtgctgggggcggggaccatgaaggattgcacatgcatgatgagggcaatgcatgcagcagtcg...

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDP06551
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
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---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CGACTCCCCAAACTGCGTGGAGCCCGCGCCGGCGGCAGAGGGGCAGCCCGACCTGCGACTGGCGCCGTGTGACCGCAGCGACAGCCAGCTGTTCTTCCTGgtggcgccggagggtgagtggcggcatgcagtgtgcgtgctgggggcggggaccatgaaggattgcacatgcatgatgagggcaatgcatgcagcagtcg

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gtgagtg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - catgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgtgcgt
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