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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCTACGATGGCTTTGCTCACCTGGCCTCGGGCCTGGCTTGCGGTCTCGCCGGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCGgtaagtctacgcagccttctcaggcattttaggttcagagtattaaccagtccttttcctggcttgcag

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDP08338
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|22072483|gb|BQ821821.1|BQ821821
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EST: gi|161819870|gb|FC110245.1|FC110245
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EST: gi|7616300|gb|AW721740.1|AW721740
EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
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EST: gi|7615848|gb|AW721288.1|AW721288
EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACNCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
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EST: gi|34985811|gb|CF559728.1|CF559728
EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
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EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
genomic: GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCGgtaagtctac ... tggcttgcagCGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
EST: gi|22053464|gb|BQ810768.1|BQ810768
EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
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EST: gi|161792813|gb|FC080728.1|FC080728
EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
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EST: gi|23364391|gb|BU652211.1|BU652211
EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
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EST:     GGTCTGGCTGCGGGTATGGCGATTGGCATCGTTGGCGACGCCGGTGTGCG                         CGCTAACGCCCAGCAACCCAAGCTGTTCGTCGGTATGATTCTGATTCTGAT
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EST: gi|14231502|gb|BG850318.1|BG850318
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