1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAGgttggtgaatgaactcttctttgactgacgatgcggtgcacgatgagcatgacgtccttcaactgtttgtgcag
species | Chlamydomonas reinhardtii |
transcript | EDP09915 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAG TCTGGCTTGATGGCTGCCGTCGCGGCCGCGGCTCTGCTGGTTGGCAGCCCCEST: gi|6544099|gb|AV389883.1|AV389883
genomic: GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAGgttggtgaat ... gtttgtgcagTCTGGCTTGATGGCTGCCGTCGCGGCCGCGGCTCTGCTGGTTGGCAGCCCC
EST: GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAG TCTGGCTTGATGGCTGCCGTCGCGGCCGCGGCTCTGCTGGTTGGCAGCCCCEST: gi|22060008|gb|BQ813654.1|BQ813654
genomic: GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAGgttggtgaat ... gtttgtgcagTCTGGCTTGATGGCTGCCGTCGCGGCCGCGGCTCTGCTGGTTGGCAGCCCC
EST: GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAG TCTGGCTTGATGGCTGCCGTCGCGGCCGCGGCTCTGCTGGTTGGCAGCCCC
genomic: GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAGgttggtgaat ... gtttgtgcagTCTGGCTTGATGGCTGCCGTCGCGGCCGCGGCTCTGCTGGTTGGCAGCCCC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGTCCATGCTGCGAAGCGGGATGGCGTGGATGTAAAGgttggtgaatgaactcttctttgactgacgatgcggtgcacgatgagcatgacgtccttcaactgtttgtgcag
- - ATGCTG
- - - TGCTGC