1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
GATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataatatggtttctcttgtaatgatatctttcgtttgtctctttcaaaaccatgactaatgttttcattcttggtctttttgcag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G55440.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|163987864|gb|EL987853.1|EL987853
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: CTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|116470932|gb|EG513524.1|EG513524
genomic: CTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|164204407|gb|ES121298.1|ES121298
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGEST: gi|164191674|gb|ES137039.1|ES137039
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCG
EST: CGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTAAGCCTEST: gi|164101449|gb|ES110820.1|ES110820
genomic: CGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGT--GCCT
EST: ACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|125120736|gb|EL168301.1|EL168301
genomic: ACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGEST: gi|86078618|gb|DR374375.1|DR374375
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGG
EST: GTGGA--GGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|124880978|gb|EH959880.1|EH959880
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGAEST: gi|164222366|gb|ES089693.1|ES089693
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGA
EST: GTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|116443935|gb|EG486527.1|EG486527
genomic: GTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|116443947|gb|EG486539.1|EG486539
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCGTTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCEST: gi|116443934|gb|EG486526.1|EG486526
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCC
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATEST: gi|124890633|gb|EH969535.1|EH969535
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCAT
EST: GGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|86081436|gb|DR377193.1|DR377193
genomic: GGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|116470943|gb|EG513535.1|EG513535
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|116483114|gb|EG525706.1|EG525706
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|116470942|gb|EG513534.1|EG513534
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|124912287|gb|EH986367.1|EH986367
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGEST: gi|124933258|gb|EL010434.1|EL010434
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGG
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGEST: gi|164086420|gb|ES132395.1|ES132395
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCG
EST: CGGTGGTGCTTCTCT-AAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|124880217|gb|EH959119.1|EH959119
genomic: CGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|116470931|gb|EG513523.1|EG513523
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|125311782|gb|EL325867.1|EL325867
genomic: GTGGACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: TGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAAEST: gi|124748142|gb|EH838272.1|EH838272
genomic: TGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
EST: ACAGGCCGATGTTGATGG-TTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAEST: gi|125112726|gb|EL163778.1|EL163778
genomic: ACAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAA
EST: TGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAG CCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA
genomic: TGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGgtacatataa ... ctttttgcagCCTGAGTTTATCGACATCATTAAGGCCGCAGAGGTGAAGAAAAGTGCCTAA