1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
CTGCAAATTTGGCACAGTTTGCAAATTTCACCATCCTAGAGACAGACAAGCTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCGgtaagctcaaagacttgtgcataattacttggttctcttcgattaaatctctgcattgtttgattttttttctttctcaaaatgatag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G02830.1 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCG GGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGTEST: gi|116473654|gb|EG516246.1|EG516246
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EST: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCG GGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGTEST: gi|116473653|gb|EG516245.1|EG516245
genomic: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCGgtaagctcaa ... aaaatgatagGGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGT
EST: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCG GGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGTEST: gi|116473655|gb|EG516247.1|EG516247
genomic: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCGgtaagctcaa ... aaaatgatagGGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGT
EST: CTCCTCCTCCTGATTGTTTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCG GGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATCCACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGTEST: gi|116478150|gb|EG520742.1|EG520742
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EST: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCG GGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGTEST: gi|86037522|gb|DR333277.1|DR333277
genomic: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCGgtaagctcaa ... aaaatgatagGGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGT
EST: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGTTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCG GGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGTEST: gi|116473656|gb|EG516248.1|EG516248
genomic: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCGgtaagctcaa ... aaaatgatagGGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGT
EST: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCG GGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGT
genomic: CTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCGgtaagctcaa ... aaaatgatagGGAGAACCGTTGTGTGTGTTCTATACACGCTATGGAATCTGCAAATTTGGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTGCAAATTTGGCACAGTTTGCAAATTTCACCATCCTAGAGACAGACAAGCTCCTCCTCCTGATTGTCTCTTAAGCTCCATTGGCCTCCCCTTACGCCCGgtaagctcaaagacttgtgcataattacttggttctcttcgattaaatctctgcattgtttgattttttttctttctcaaaatgatag
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