1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
CAAGGTTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGGAGCGGGAAGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatattgtcaaacatttaatctctttttgctatctcagttcgttctcgtttacagtgagacctgttttgatgatagtgatgcccgtttctacgcactatactcccttagtgtgtgattcaaaccccacagaaatatttgttggctaaaaaactctttttgttggtaatggcag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G55440.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434595|gb|EG477187.1|EG477187
genomic: CCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125154189|gb|EL184929.1|EL184929
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: CATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434695|gb|EG477287.1|EG477287
genomic: CATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|86079485|gb|DR375242.1|DR375242
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125238989|gb|EL253074.1|EL253074
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: GCTGGATCGACCTATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGEST: gi|164229717|gb|ES160752.1|ES160752
genomic: GCTGGATCGACC-ATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGTACAAACTAGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACEST: gi|125259654|gb|EL273739.1|EL273739
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTG-ACAAACT-GGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAAC
EST: CTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116470932|gb|EG513524.1|EG513524
genomic: CTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434684|gb|EG477276.1|EG477276
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|86078618|gb|DR374375.1|DR374375
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|124710897|gb|EH802299.1|EH802299
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAAEST: gi|124890458|gb|EH969360.1|EH969360
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAA
EST: TGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125258494|gb|EL272579.1|EL272579
genomic: TGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTEST: gi|116434506|gb|EG477098.1|EG477098
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGT
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434673|gb|EG477265.1|EG477265
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|124811714|gb|EH896580.1|EH896580
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: GCTGGATCGACCATTGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGEST: gi|124888452|gb|EH967354.1|EH967354
genomic: GCTGGATCGACCA-TGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAG
EST: ATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434661|gb|EG477253.1|EG477253
genomic: ATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125211515|gb|EL226469.1|EL226469
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGEST: gi|163982458|gb|ES080038.1|ES080038
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGEST: gi|125086724|gb|EL146113.1|EL146113
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAAATGTTGTCATAGCCTATEST: gi|125135871|gb|EL175957.1|EL175957
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAA-TGTTGTCATAGCCTAT
EST: GCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAEST: gi|116434628|gb|EG477220.1|EG477220
genomic: GCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCA-GACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACA
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTCGCGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116443947|gb|EG486539.1|EG486539
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116443934|gb|EG486526.1|EG486526
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125179272|gb|EL197157.1|EL197157
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: ACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434739|gb|EG477331.1|EG477331
genomic: ACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434539|gb|EG477131.1|EG477131
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|124955760|gb|EL030747.1|EL030747
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATEST: gi|125310498|gb|EL324583.1|EL324583
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAAT
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGEST: gi|116470943|gb|EG513535.1|EG513535
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125035319|gb|EL107588.1|EL107588
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGEST: gi|124863876|gb|EH948313.1|EH948313
genomic: AGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGG-TCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGG
EST: CTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116483114|gb|EG525706.1|EG525706
genomic: CTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: GATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125195864|gb|EL210818.1|EL210818
genomic: GATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAAEST: gi|116470942|gb|EG513534.1|EG513534
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAA
EST: GGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434639|gb|EG477231.1|EG477231
genomic: GGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|164228770|gb|ES040719.1|ES040719
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATEST: gi|164054993|gb|ES139916.1|ES139916
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCAT
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTEST: gi|164215072|gb|ES152617.1|ES152617
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTT
EST: GATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTAGGEST: gi|116434584|gb|EG477176.1|EG477176
genomic: GATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGT-GG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434617|gb|EG477209.1|EG477209
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTCGCGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|124937258|gb|EL014048.1|EL014048
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: GTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125225691|gb|EL239776.1|EL239776
genomic: GTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: CCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|164201975|gb|ES093717.1|ES093717
genomic: CCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|125033485|gb|EL105754.1|EL105754
genomic: AGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: GCTGGATCGACCATAGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTEST: gi|124890216|gb|EH969118.1|EH969118
genomic: GCTGGATCGACCAT-GGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGT
EST: AGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTTTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGEST: gi|164100015|gb|ES174055.1|ES174055
genomic: AGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGG--TCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTG
EST: GCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTAGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGEST: gi|124908158|gb|EH982238.1|EH982238
genomic: GCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACT-GGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGG
EST: CCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434495|gb|EG477087.1|EG477087
genomic: CCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|124961935|gb|EL036394.1|EL036394
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAAEST: gi|124897899|gb|EH974113.1|EH974113
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAA
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCEST: gi|125305594|gb|EL319679.1|EL319679
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTC
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTAEST: gi|164196841|gb|ES143437.1|ES143437
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTA
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAAEST: gi|116470931|gb|EG513523.1|EG513523
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAA
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434717|gb|EG477309.1|EG477309
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGACTATTACCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|124839898|gb|EH924337.1|EH924337
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: GGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGTEST: gi|164126386|gb|ES203289.1|ES203289
genomic: GGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGC-TATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGG
EST: CAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTTGGTTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGEST: gi|124834261|gb|EH918700.1|EH918700
genomic: CAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAAC-TGG-TCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTEST: gi|125001146|gb|EL073415.1|EL073415
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGT
EST: GGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116430495|gb|EG473087.1|EG473087
genomic: GGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCGTGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGEST: gi|116434650|gb|EG477242.1|EG477242
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
EST: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCG ATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
genomic: AGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatat ... gtaatggcagATCGGGTGACAAACTGGTCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CAAGGTTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGGAGCGGGAAGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACCAAGGCTATTGCCGgtatgtatattgtcaaacatttaatctctttttgctatctcagttcgttctcgtttacagtgagacctgttttgatgatagtgatgcccgtttctacgcactatactcccttagtgtgtgattcaaaccccacagaaatatttgttggctaaaaaactctttttgttggtaatggcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CATGGA