1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
CAAGAACCGTTCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAAAGGTTAAAGACTTACAAGGCTAAGTTGGTGGTGTTCCCTCGCCGTTCCCGTCAAGTCAAGgtatcaatcatttgagatcttagttagagtagtatatttgagacaccctcttgattcttgagttcttgttataacaattttgtatcttttgttttcag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G23900.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CCTCGCCGTTCCCGCCAAGTCAAG GCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGCTTGCCAATGCTACTCAAGTTCAAGGTEST: gi|124704010|gb|EH795412.1|EH795412
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genomic: GCTAAGTTGGTGGTGTTCCCTCGCCGTTCCCGTCAAGTCAAGgtatcaatca ... ttgttttcagGCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGCTTGCCAATGCTACTCAAGTTCAAGGT
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EST: TGGTGTTCCCTCGCCGTTCCCGTCAAGTCAAG GCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGCTTGCCAATGCTACTCAAGTTCAAGGT
genomic: TGGTGTTCCCTCGCCGTTCCCGTCAAGTCAAGgtatcaatca ... ttgttttcagGCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGCTTGCCAATGCTACTCAAGTTCAAGGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CAAGAACCGTTCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAAAGGTTAAAGACTTACAAGGCTAAGTTGGTGGTGTTCCCTCGCCGTTCCCGTCAAGTCAAGgtatcaatcatttgagatcttagttagagtagtatatttgagacaccctcttgattcttgagttcttgttataacaattttgtatcttttgttttcag
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